IndietroAutore: Silvestri Ludovico 1) 3D molecular phenotyping of cleared human brain tissues with light-sheet fluorescence microscopy in COMMUNICATIONS BIOLOGYDi: Pesce Luca; Scardigli Marina; Gavryusev Vladislav; Laurino Annunziatina; Mazzamuto Giacomo; Brady Niamh; Sancataldo Giuseppe; Silvestri Ludovico; Destrieux Christophe; Hof Patrick R.; Costantini Irene; Pavone Francesco S. Anno: 2022 (Cit.: 0 DOI: 10.1038/s42003-022-03390-0)
2) Fast whole-brain imaging of seizures in zebrafish larvae by two-photon light-sheet microscopy in BIOMEDICAL OPTICS EXPRESSDi: De Vito G., Turrini L., Müllenbroich C., Ricci P., Sancataldo G., Mazzamuto G., Tiso N., Sacconi L., Fanelli D., Silvestri L., Vanzi F., Pavone FS. Anno: 2022 (Cit.: 11 DOI: 10.1364/BOE.434146)
3) Autofluorescence enhancement for label‑free imaging of myelinated fibers in mammalian brains in SCIENTIFIC REPORTSDi: Costantini I., Baria E., Sorelli M., Matuschke F., Giardini F., Menzel M., Mazzamuto G., Silvestri L., Cicchi R., Amunts K., Axer M., Pavone F.S. Anno: 2021 (Cit.: 16 DOI: 10.1038/s41598-021-86092-7)
4) Comparison of Different Tissue Clearing Methods for Three-Dimensional Reconstruction of Human Brain Cellular Anatomy Using Advanced Imaging Techniques in FRONTIERS IN NEUROANATOMYDi: Scardigli M., Pesce L., Brady N., Mazzamuto G., Gavryusev V., Silvestri L., Hof PR., Destrieux C., Costantini I., Pavone FS. Anno: 2021 (Cit.: 0 DOI: 10.3389/fnana.2021.752234)
5) Large-scale, cell-resolution volumetric mapping allows layer-specific investigation of human brain cytoarchitecture in BIOMEDICAL OPTICS EXPRESSDi: Costantini I., Mazzamuto G., Roffilli M., Laurino A., Castelli FM., Neri M., Lughi G., Simonetto A., Lazzeri E., Pesce L., Destrieux C., Silvestri L., Conti V., Guerrini R., Pavone FS Anno: 2021 (Cit.: 12 DOI: 10.1364/BOE.415555)
6) Universal autofocus for quantitative volumetric microscopy of whole mouse brains in NATURE METHODSDi: Silvestri L., Mullenbroich MC., Costantini I., Di Giovanna AP., Mazzamuto G., Franceschini A., Kutra D., Kreshuk A., Checcucci C., Toresano LO., Frasconi P., Sacconi L., Pavone FS. Anno: 2021 (Cit.: 26 DOI: 10.1038/s41592-021-01208-1)
7) Inferring network structure and local dynamics from neuronal patterns with quenched disorder in CHAOS SOLITONS & FRACTALSDi: Adam I., Cecchini G., Fanelli D., Kreuz T., Livi R., di Volo M., Mascaro Allegra AL., Conti E., Scaglione A., Silvestri L., Pavone FS. Anno: 2020 (Cit.: 0 DOI: 10.1016/j.chaos.2020.110235)
8) Effects of excitation light polarization on fluorescence emission in two-photon light-sheet microscopy in BIOMEDICAL OPTICS EXPRESSDi: de Vito G., Ricci P., Turrini L., Gavryusev V., Mullenbroich C., Tiso N., Vanzi F., Silvestri L., Pavone FS. Anno: 2020 (Cit.: 13 DOI: 10.1364/BOE.396388)
9) Fast multi-directional DSLM for confocal detection without striping artifacts in BIOMEDICAL OPTICS EXPRESSDi: Ricci P., Santacaldo G., Gavryusev V., Franceschini A., Mullenbroich MC., Silvestri L., Pavone FS. Anno: 2020 (Cit.: 13 DOI: 10.1364/BOE.390916)
10) Dissecting Neuronal Activation on a Brain-Wide Scale With Immediate Early Genes in FRONTIERS IN NEUROSCIENCEDi: Franceschini A., Costantini I., Pavone FS., Silvestri L. Anno: 2020 (Cit.: 26 DOI: 10.3389/fnins.2020.569517)
11) Toward a High-Resolution Reconstruction of 3D Nerve Fiber Architectures and Crossings in the Brain Using Light Scattering Measurements and Finite-Difference Time-Domain Simulations in PHYSICAL REVIEW XDi: Menzel M., Axer M., De Raedt H., Costantini I., Silvestri L., Pavone FS., Amunts K., Amunts K., Michielsen K. Anno: 2020 (Cit.: 17 DOI: 10.1103/PhysRevX.10.021002)
12) Deep learning strategies for scalable analysis of high-resolution brain imagery
Di: Mazzamuto G., Orsini F., Roffilli M., Frasconi P., Pavone F. S., Silvestri S. Anno: 2019 (Cit.: 0)
13) In-vivo and ex-vivo optical clearing methods for biological tissues: review in BIOMEDICAL OPTICS EXPRESSDi: Costantini I., Cicchi R., Silvestri L., Vanzi F., Pavone F.S. Anno: 2019 (Cit.: 104 DOI: 10.1364/BOE.10.005251)
14) Tailored Sample Mounting for Light-Sheet Fluorescence Microscopy of Clarified Specimens by Polydimethylsiloxane Casting in FRONTIERS IN NEUROANATOMYDi: Di Giovanna AP., Credi C., Franceschini A., Muellenbroich MC., Silvestri L., Pavone FS. Anno: 2019 (Cit.: 8 DOI: 10.3389/fnana.2019.00035)
15) Dual-beam confocal light-sheet microscopy via flexible acousto-optic deflector in JOURNAL OF BIOMEDICAL OPTICSDi: Gavryusev V., Sancataldo G., Ricci P., Montalbano A., Fornetto C., Turrini L., Laurino A., Pesce L., de Vito G., Tiso N., Vanzi F., Silvestri L., Pavone FS. Anno: 2019 (Cit.: 22 DOI: 10.1117/1.JBO.24.10.106504)
16) Advanced fluorescence microscopy for in vivo imaging of neuronal activity in OPTICADi: Sancataldo Giuseppe; Silvestri Ludovico; Mascaro Anna Letizia Allegra; Sacconi Leonardo; Pavone Francesco Saverio Anno: 2019 (Cit.: 26 DOI: 10.1364/OPTICA.6.000758)
17) Whole-Brain Vasculature Reconstruction at the Single Capillary Level (vol 8, 12573, 2018) in SCIENTIFIC REPORTSDi: Di Giovanna AP., Tibo A., Silvestri L., Mullenbroich MC., Costantini I., Allegra Mascaro AL., Sacconi L., Frasconi P., Pavone FS. Anno: 2019 (Cit.: 0 DOI: 10.1038/s41598-019-42216-8)
18) Bessel Beam Illumination Reduces Random and Systematic Errors in Quantitative Functional Studies Using Light-Sheet Microscopy (vol 12, 315, 2018) in FRONTIERS IN CELLULAR NEUROSCIENCEDi: Muellenbroich MC., Turrini L., Silvestri L., Alterini T., Gheisari A., Tiso N., Vanzi F., Sacconi L., Pavone FS. Anno: 2019 (Cit.: 1 DOI: 10.3389/fncel.2019.00025)
19) Flexible Multi-Beam Light-Sheet Fluorescence Microscope for Live Imaging Without Striping Artifacts in FRONTIERS IN NEUROANATOMYDi: Sancataldo G., Gavryusev V., de Vito G., Turrini L., Locatelli M., Fornetto C., Tiso N., Vanzi F., Silvestri L., Pavone FS.
Anno: 2019 (Cit.: 20 DOI: 10.3389/fnana.2019.00007)
20) Three-dimensional analysis of human brain cytoarchitectonics by means of a SWITCH/TDE-combined clearing method Di: Costantini I., Mazzamuto G., Laurino A., Lazzari E., Sacconi L., Neri M., Simonetto A., Ruffilli M., Silvestri L., Pavone FS. Anno: 2019 (Cit.: 0)
21) Reply to Entcheva: The impact of T-tubules on action potential propagation in cardiac tissue in PROCEEDINGS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCESDi: Scardigli M., Crocini C., Ferrantini C., Gabbrielli T., Silvestri L., Coppini R., Tesi C., Rog-Zielinska E. A., Kohl P., Cerbai E., Poggesi C., Pavone F.S., Sacconi L. Anno: 2018 (Cit.: 0 DOI: 10.1073/pnas.1720253115)
22) Confocal multispot microscope for fast and deep imaging in semicleared tissues in JOURNAL OF BIOMEDICAL OPTICSDi: Adam M.P., Muellenbroich M.C., Di Giovanna A.P., Alfieri D., Silvestri L., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2018 (Cit.: 1 DOI: 10.1117/1.JBO.23.2.020503)
23) Whole-Brain Vasculature Reconstruction at the Single Capillary Level in SCIENTIFIC REPORTSDi: Di Giovanna A.P., Tibo A., Silvestri L., Muellenbroich M.C., Costantini I., Allegra Mascaro A.L., Sacconi L., Frasconi P., Pavone F.S. Anno: 2018 (Cit.: 77 DOI: 10.1038/s41598-018-30533-3)
24) Bessel Beam Illumination Reduces Random and Systematic Errors in Quantitative Functional Studies Using Light-Sheet Microscopy in FRONTIERS IN CELLULAR NEUROSCIENCEDi: Muellenbroich M. C., Turrini L., Silvestri L., Alterini T., Gheisari A., Vanzi F., Sacconi L., Pavone F. S. Anno: 2018 (Cit.: 28 DOI: 10.3389/fncel.2018.00315)
25) High-fidelity imaging in brain-wide structural studies using light-sheet microscopy in ENEURODi: Müllenbroich M.C., Silvestri L., Di Giovanna A.P., Mazzamuto G., Costantini I., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2018 (Cit.: 11 DOI: 10.1523/ENEURO.0124-18.2018)
26) Towards a full volumetric atlas of cell-specific neuronal spatial organization in the entire mouse brain Di: Silvestri L., Di Giovanna A.P., Mazzamuto G., Leergard T., Orsini F., Costantini I., Bjaalie J., Frasconi P., Pavone F.S. Anno: 2018 (Cit.: 0)
27) Software tools for efficient processing of high-resolution 3D images of macroscopic brain samples Di: Mazzamuto G., Silvestri L., Costantini I., Orsini F., Roffilli M., Frasconi P., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2018 (Cit.: 0)
28) 3D human brain digital istopatology Di: Costantini I., Mazzamuto G., Silvestri L., Neri M., Roffilli M., Conti V., Guerrini R., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2018 (Cit.: 0 DOI: 10.1364/BRAIN.2018.BF4C.1)
29) Automatic Segmentation of Neurons in 3D Samples of Human Brain Cortex Di: Mazzamuto G., Costantini I., Neri M., Roffilli M., Silvestri L., Pavone F.S. Anno: 2018 (Cit.: 0)
30) Quantitative assessment of passive electrical properties of the cardiac T-tubular system by FRAP microscopy in PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICADi: Scardigli M., Crocini C., Ferrantini C., Gabbrielli T., Silvestri L., Coppini R., Tesi C., Rog-Zielinska E., Kohl P., Cerbai E., Poggesi C., Pavone F. S., Sacconi L. Anno: 2017 (Cit.: 31 DOI: 10.1073/pnas.1702188114)
31) Correlative polarized light imaging and two-photon fluorescence microscopy for 3D myelinated fibers reconstruction Di: Costantini I., Menzel M., Silvestri L., Schubert N., Axer M., Amunts K., Pavone F.S. Anno: 2017 (Cit.: 0)
32) Fast, image-based autofocus system for high-resolution optical microscopy of whole mouse brains Di: Silvestri L., Müllenbroich M.C., Costantini I., Di Giovanna A.P., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2017 (Cit.: 0 DOI: 10.1364/BODA.2017.JTu4A.8)
33) Optimal staining and clearing protocol for whole mouse brain vasculature imaging with light-sheet microscopy Di: Di Giovanna A.P., Tibo A., Silvestri L., Muellenbroich M.C., Costantini I., Sacconi L., Frasconi P., Pavone F.S. Anno: 2017 (Cit.: 0)
34) High-fidelity imaging with bessel-beam light-sheet microscopy for whole-brain structural and functional studies Di: Mu¨llenbroich M.C., Silvestri L., Turrini L., Di Giovanna A.P., Alterini T., Gheisari A., Sacconi L., Vanzi F., Pavone F.S. Anno: 2017 (Cit.: 0 DOI: 10.1364/BRAIN.2017.BrW4B.2)
35) High-fidelity functional and structural whole-brain imaging with Bessel-beam light-sheet microscopy Di: Mullenbroich MC., Silvestri L., Turrini L., Di Giovanna AP., Alterini T., Gheisari A., Ricci P., Sacconi L., Vanzi F., Pavone FS. Anno: 2017 (Cit.: 0)
36) Multi-Modal Optical Imaging of the Cerebellum in Animals in CEREBELLUMDi: Allegra Mascaro A.L., Sacconi L., Silvestri. L., Knott G., Pavone F.S. Anno: 2016 (Cit.: 0 DOI: 10.1007/s12311-015-0730-4)
37) Clearing of fixed tissue: a review from a microscopist´s perspective in JOURNAL OF BIOMEDICAL OPTICSDi: Silvestri L., Costantini I., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2016 (Cit.: 103 DOI: 10.1117/1.JBO.21.8.081205)
38) Sistema e metodo di misura della focalizzazione di uno strumento ottico Di: Silvestri L., Muellenbroich M.C., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2016 (Cit.: 0)
39) Towards a comprehensive understanding of brain machinery by correlative microscopy in JOURNAL OF BIOMEDICAL OPTICSDi: Allegra Mascaro A. M., Silvestri L., Sacconi L., Pavone F. S. Anno: 2015 (Cit.: 11 DOI: 10.1117/1.JBO.20.6.061105)
40) A versatile clearing agent for multi-modal brain imaging in SCIENTIFIC REPORTSDi: Costantini I., Ghobril J.P., Di Giovanna A.P., Allegra Mascaro A. L., Silvestri L., Müllenbroich M.C., Onofri L., Conti V., Vanzi F., Sacconi L., Guerrini R., Markram H., Iannello G., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 183 DOI: 10.1038/srep09808)
41) Comprehensive optical and data management infrastructure for high-throughput light-sheet microscopy of whole mouse brains in NEUROPHOTONICSDi: Muellenbroich M.C., Silvestri L., Onofri L., Costantini I., Van’t Hoff M., Sacconi L., Iannello G., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 17 DOI: 10.1117/1.NPh.2.4.041404)
42) Quantitative neuroanatomy of all Purkinje cells with light sheet microscopy and high-throughput image analysis in FRONTIERS IN NEUROANATOMYDi: Silvestri L., Paciscopi M., Soda P., Biamonte F., Iannello G., Frasconi P., Pavone F. S. Anno: 2015 (Cit.: 30 DOI: 10.3389/fnana.2015.00068)
43) Whole brain optical imaging Di: Silvestri L., Allegra Mascaro A.L., Costantini I., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1117/12.2087339)
44) A multi modal clearing method for brain imaging Di: Costantini I., Mascaro A.L.A., Di Giovanna A.P., Silvestri L., Müllenbroich M.C., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1364/BRAIN.2015.BrM3B.2)
45) A new versatile clearing method for brain imaging Di: Costantini I., Di Giovanna A.P., Allegra Mascaro A.L., Silvestri L., Müllenbroich M.C., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1117/12.2076908)
46) Multiphoton microscopy in brain imaging Di: Allegra Mascaro A.L., Silvestri L., Costantini I., Sacconi L., Maco B., Knott G.W., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1117/12.2084183)
47) A versatile new technique to clear mouse and human brain Di: Costantini I., Di Giovanna A.P., Mascaro A.L.A., Silvestri L., Müllenbroich M.C., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1117/12.2184289)
48) Brain-wide charting of neuronal activation maps with cellular resolution Di: Silvestri L., Rudinskiy N., Paciscopi M., Müllenbroich M.C., Costantini I., Sacconi L., Frasconi P., Hyman B.T., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1364/BRAIN.2015.BrM3B.6)
49) Brain imaging from the nano- to the macro-scale Di: Silvestri L., Allegra Mascaro A.L., Costantini I., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1109/NER.2015.7146760)
50) Correlative two-photon and light sheet microscopy in METHODSDi: Silvestri L., Allegra Mascaro A. M., Costantini I., Sacconi L., Pavone F. S. Anno: 2014 (Cit.: 26 DOI: 10.1016/j.ymeth.2013.06.013)
51) Correcting Spherical Aberrations in Confocal Light Sheet Microscopy: A Theoretical Study in MICROSCOPY RESEARCH AND TECHNIQUEDi: Silvestri L., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2014 (Cit.: 13 DOI: 10.1002/jemt.22330)
52) Large-scale automated identification of mouse brain cells in confocal light sheet microscopy images in BIOINFORMATICSDi: Frasconi P., Silvestri L., Soda P., Cortini R., Pavone F. S., Iannello G. Anno: 2014 (Cit.: 45 DOI: 10.1093/bioinformatics/btu469)
53) Exploring the brain on multiple scales with correlative two-photon and light sheet microscopy Di: Silvestri L., Allegra Mascaro A.L., Costantini I., Sacconi L., Pavone SF. Anno: 2014 (Cit.: 0 DOI: 10.1117/12.2037867)
54) Breakthroughs in Photonics 2012: Nonlinear Laser Imaging for Neuroscience in IEEE PHOTONICS JOURNALDi: Allegra Mascaro A. L., Silvestri L., Sacconi L., Pavone FS. Anno: 2013 (Cit.: 2 DOI: 10.1109/JPHOT.2013.2250941)
55) Advanced optical techniques to explore brain structure and function in JOURNAL OF INNOVATIVE OPTICAL HEALTH SCIENCESDi: Silvestri L., Allegra Mascaro A.L., Lotti J., Sacconi L., Pavone FS. Anno: 2013 (Cit.: 19 DOI: 10.1142/S1793545812300029)
56) The connectomics challenge in FUNCTIONAL NEUROLOGYDi: Silvestri L., Sacconi L., Pavone FS. Anno: 2013 (Cit.: 13 DOI: 10.11138/FNeur/2013.28.3.167)
57) Micron-scale Resolution Optical Tomography of Entire Mouse Brains with Confocal Light Sheet Microscopy in JOVE-JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTSDi: Silvestri L., Bria A., Costantini I., Sacconi L., Peng H., Iannello G., Pavone F.S. Anno: 2013 (Cit.: 17 DOI: 10.3791/50696)
58) Light sheet microscopy of cleared mouse brains: aberrations effects caused by refractive index mismatch Di: Silvestri L., Sacconi L., Pavone FS. Anno: 2013 (Cit.: 0 DOI: 10.1117/12.2032488)
59) Neural plasticity explored by correlative two-photon and electron/spim microscopy Di: Mascaro A.L.Allegra, Silvestri L., Costantini I., Sacconi L., Maco B., Knott G.W., Pavone F.S. Anno: 2013 (Cit.: 0 DOI: 10.1117/12.2032505)
60) Confocal light sheet microscopy: micron-scale neuroanatomy of the entire mouse brain in OPTICS EXPRESSDi: Silvestri L., Bria A., Sacconi L., Iannello G., Pavone FS. Anno: 2012 (Cit.: 183 DOI: 10.1364/OE.20.020582)
61) Event-driven power-law relaxations in weak turbulence in PHYSICAL REVIEW LETTERSDi: Silvestri L., Fronzoni L., Grigolini P., Allegrini P. Anno: 2009 (Cit.: 55 DOI: 10.1103/PhysRevLett.102.014502)
62) Experimental Quenching of Harmonic Stimuli: Universality of Linear Response Theory in PHYSICAL REVIEW LETTERSDi: Allegrini P., Bologna M., Fronzoni L., Grigolini P., Silvestri L. Anno: 2009 (Cit.: 31 DOI: 10.1103/PhysRevLett.103.030602)